Как выглядит флотская военная иерархия Альянса? Отличается ли флотская военная иерархия Альянса от иерархии сухопутных войск?

Да.

Иерархия во флоте Альянса выглядит следующим образом:

Верховный адмирал Адмирал (Небесный адмирал) Вице-адмирал Контр-адмирал Верховный капитан Капитан (Небесный капитан) Лейтенант Мичман Старший матрос Матрос (Небесный матрос)